สังฆมณฑลอุบลราชธานี ได้ก่อตั้ง “โรงเรียนสัพพัญญูวิทยาสงเคราะห์” เมื่อวันที่ 31 พฤษภาคม  พ.ศ. 2500  ณวัดโรมันคาทอลิก  หมู่ 3  ถนนพรหมราช  ต.ในเมือง เมือง จ.อุบลราชธานี เปิดทำการสอน ตั้งแต่มัธยมปีที่ 1 ถึงมัธยมปีที่ 6(ตามหลักสูตรพุทธศักราช2498)  เปิดรับเฉพาะนักเรียนชาย โดยมี บาทหลวงบุบผา  สลับเชื้อเป็นผู้อำนวยการท่านแรกต่อมาในปี พ.ศ. 2503  บาทหลวงบุญเรือง  ศิลาโคตร ซึ่งดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการท่านที่สอง ได้ย้ายโรงเรียนมาตั้งอยู่ ณ บ้านเลขที่ 500 ถนนชยางกูร ต.ในเมือง อ.เมือง จ. อุบลราชธานี   ภายในพื้นที่  20 ไร่  2  งาน 4  ตารางวา(อันเป็นสถานที่ตั้งของ โรงเรียน ปัจจุบัน)ต่อมาในปีการศึกษา  2508 พระสังฆราชเกลาดิอุส บาเยมุขนายกสังฆมณฑลอุบลราชธานีได้มอบกิจการโรงเรียนให้คณะภราดาคณะเซนต์คาเบรียลแห่งประเทศไทยมาบริหารและ ได้ทำการเปลี่ยนชื่อโรงเรียนเป็น" โรงเรียนอัสสัมชัญอุบลราชธานี" ในปี พ.ศ. 2508 โดยมีภราดารุ่นแรก  4  ท่านมาบริหารประกอบด้วยภราดาเซราฟินเป็นอธิการ  ภราดาชุมพล ดีสุดจิต ภราดาสมบูรณ์  มังคลานนท และภราดาอารมณ์  พูนโภคผล

      ตลอดระยะเวลาที่ผ่านมาคณะภราดาคณะเซนต์คาเบรียลแห่งประเทศไทย ได้ส่งคณะภราดาเข้ามาบริหาร โรงเรียนและสืบสานงานอย่างต่อเนื่อง โดยจัดการศึกษาให้แก่เด็กและเยาวชน อบรมสั่งสอนเยาวชน ให้มี ความรู้อย่างลึกซึ้ง เพื่อสามารถนำความรู้ไปประกอบอาชีพและดำรงตน ให้เป็นประโยชน์ต่อสังคมและ ประเทศชาติ   

รายนามคณะภราดาที่มาร่วมบริหารโรงเรียนตั้งแต่อดีตถึงปัจจุบัน